La struttura scientifica operativa dell'ISEA è basata su sei aree scientifiche che si occupano di ricerca applicata:

• Elettronica digitale, microelettronica e bioelettronica
• Elettronica analogica e radiofrequenza, telecom e sistemi per l'imaging
• Elettronica di potenza e applicata all'energia 
• Sistemi meccatronici
• Sistemi microtecnici di precisione 
• Fotonica applicata e optoelettronica. 

Le aree scientifiche, in sinergia, si occupano dello sviluppo di progetti in ambito di telecomunicazioni e alta frequenza, sistemi di precisione, regolazione e controllo, microelettronica e microtecnica, elettronica di potenza e fotonica.

Inoltre, il costante aggiornamento delle competenze delle aree scientifiche grazie a progetti di ricerca garantisce che i contenuti del Corso di laurea in ingegneria elettronica siano costantemente attualizzati.  

A questi si aggiungiunge l'unità dei Servizi elettronici (SEL) per il supporto e la gestione dell'infrastruttura e la fabbricazione di schede elettroniche per la ricerca e la formazione.