Tecniche diagnostiche attuali per l'identificazione di microrganismi: sequenziamento di DNA e MALDI-TOF MS

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Tecniche diagnostiche attuali per l'identificazione di microrganismi: sequenziamento di DNA e MALDI-TOF MS

La diagnosi di funghi e batteri è stata a lungo basata sugli esami classici: microscopia, colture in piastre, test biochimici e sierologici. Questo tipo di approccio, considerato "tradizionale", può avere esiti non esaustivi e molto spesso, principalmente nell’identificazione fungina, consente l'identificazione del genere, ma non della specie a cui appartiene il microrganismo.
Altre limitazioni di questo approccio classico sono che non tutti i microrganismi possono essere coltivati in condizioni di laboratorio ed eventuali contaminazioni possono rendere difficoltosa l'identificazione. Inoltre, l’identificazione tramite metodi classici è una attività molto laboriosa e "time-consuming".
Gli sviluppi nel campo della diagnostica molecolare basati sul sequenziamento del DNA e sullo studio delle proteine con l’utilizzo della spettrometria di massa hanno consentito di approcciare la diagnosi di batteri e funghi con metodi innovativi, veloci, efficaci e molto performanti.

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SUPSI Course Overview

Panoramica

  • Titolo

    Tecniche diagnostiche attuali per l'identificazione di microrganismi: sequenziamento di DNA e MALDI-TOF MS

  • Crediti

    1,0 ECTS

  • Data inizio

    --

  • Data fine

    --

  • Termine d'iscrizione

    30 settembre 2024

  • Lingua

    Italiano

  • Costo

    CHF 900 *

  • Durata

    0 ore-lezione

  • Erogazione

    In presenza

  • Modalità di frequenza

    Frequenza da definire

*Informazioni di dettaglio disponibili alla voce Ulteriori dettagli sui costi

Course Text Info

• Corso diagnostica molecolare (parte I):
La partecipazione alle attività formative previste consentirà di acquisire conoscenze teoriche e pratiche sull’uso del sequenziamento delle regioni conservate 16S rRNA e ITS, con il metodo di Sanger, per l’identificazione di batteri, lieviti e funghi filamentosi.

• Corso di spettrometria di massa MALDI-TOF Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization- Time of fly (parte II):
La partecipazione alle attività formative previste consentirà di acquisire conoscenze teoriche e pratiche sull’uso della spettrometria di massa MALDI-TOF per l’identificazione di batteri, lieviti e funghi filamentosi.

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Conoscenze base di biologia e microbiologia.

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Corso diagnostica molecolare (parte I):
• Parte Teorica
Acidi nucleici, geni e genoma
La struttura chimica del DNA
Metodi di estrazione del DNA
PCR (polymerase chain reaction) ampio spetro
Real Time e Retro Trascrizionale PCR
Regioni conservate 16S rRNA e Internal Transcribed Spacer (ITS)
Sequenziamento di Sanger
• Parte Pratica
Estrazione di DNA di batteri, lieviti e funghi filamentosi.
PCR ad ampio spettro
Controllo degli amplificati PCR in gel agarosio
Reazione di sequenza
Identificazione microrganismi: confronto della sequenza di interesse con un database di sequenze già conosciute (BLAST Basic Local Alignment Search Tool)

Corso di spettrometria di massa MALDI-TOF Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization- Time of fly (parte II):
• Parte Teorica
Introduzione alla spettrometria di massa MALDI-TOF.
Applicazioni dell’uso della spettrometria di massa MALDI-TOF in vari ambiti
Spettrometria di massa MALDI-TOF per l’identificazione di batteri, lieviti e funghi filamentosi: preparazione, analisi ed identificazione
• Parte Pratica
Applicazione di protocolli per la preparazione di batteri, lieviti e funghi filamentosi.
Analisi di spettrometria di massa MALDI-TOF, sistema Axima (bioMérieux).
Identificazione di microrganismi tramite varie banche dati.

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Ambiente e scienze della vita

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Il seguente modulo si suddivide in due corsi:
• Corso diagnostica molecolare (parte I)
• Corso di spettrometria di massa MALDI-TOF (parte II)

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SUPSI Course FC Dates

Per andare incontro alle esigenze personali e professionali, la programmazione delle date sarà concordata direttamente con le/gli iscritte/i non appena raggiunto il numero di partecipanti adeguato a garantire un ottimale apprendimento dei contenuti proposti.

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Gli orari verranno concordati secondo le esigenze professionali al termine delle iscrizioni.

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Frequenza da definire

SUPSI Course FC Locations

SUPSI Department of Environment, Construction and Design
Mendrisio Campus
Via Flora Ruchat-Roncati 15
CH - 6850 Mendrisio


Istituto di Microbiologia (IM)
Via Mirasole 22a
CH - 6501 Bellinzona

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Dipartimento ambiente costruzioni e design

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Il costo totale del corso (parte I e parte II) ammonta a 900 CHF.
I membri delle Associazioni affiliate alla CAT beneficiano di uno sconto del 10% sul corso.

SUPSI Course FC Contacts

Amministrazione corso:
SUPSI Formazione continua
+41 58 666 63 10
dacd.fc@supsi.ch

SUPSI Course FC Responsibles

Dr. Cristina Corti, Istituto di Microbiologia (IM), Dipartimento ambiente, costruzioni e design (DACD).

SUPSI Course FC Teachers

• Dr. Cristina Corti, Istituto di Microbiologia (IM), Dipartimento ambiente, costruzioni e design (DACD).

• Sophie De Respinis, Istituto di Microbiologia (IM), Dipartimento ambiente, costruzioni e design (DACD).

Course Contact

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